Depuis le 1er janvier 2018, Niort Agglo a pris la compétence GEMAPI, in-extenso Gestion des Milieux Aquatiques et Prévention des Inondations. Cette compétence concerne l’aménagement des bassins hydrographiques (ou partie), l’entretien et l’aménagement des cours d'eau, canaux, lacs ou plans d’eau et leurs accès, la défense contre les inondations, et la protection et la restauration des sites, des écosystèmes aquatiques et des zones humides, ainsi que des formations boisées riveraines.
Cette compétence relevait jusqu'à cette date des communes qui, sur le territoire de Niort Agglo, l’exerçaient directement ou, pour la plupart, via une adhésion à des syndicats de rivières.
